使用食品凍干機(jī)時(shí)，根據(jù)實(shí)際樣品采用不同的凍干方式，常見形式有：實(shí)驗(yàn)室型，全部采用ProcessB，在凍干腔內(nèi)凍干或掛瓶?jī)龈?，若采用凍干腔凍干，需要選擇凍干腔。
    做西林瓶?jī)龈蓵r(shí)，需要選用壓蓋裝置；
    掛瓶?jī)龈蓵r(shí)，選擇多歧管，適用于：圓底燒瓶，寬口濾瓶，安瓿瓶，注意是否需要適配器結(jié)合使用；
    若在凍干過程中涉及到的樣品既有腔內(nèi)凍干，也有外掛瓶?jī)龈?，可以選擇帶外掛口的凍干腔。
    對(duì)于食品、中草藥、粉末材料或者其他樣品來說，建議采用擱板型凍干機(jī)；對(duì)于西林瓶操作，必須選擇壓蓋裝置；微生物菌種凍干保存，建議采用掛瓶式，并選擇安瓿瓶適配器；如果做凍干工藝曲線研究，必須選擇控制器可支持共晶點(diǎn)測(cè)試裝置和軟件等工作機(jī)型。
    理論上講，露點(diǎn)溫度接近0℃，但在食品凍干機(jī)的實(shí)際工作情況來看，性能優(yōu)良的設(shè)備露點(diǎn)溫度控制在5℃。只要制冷系統(tǒng)出現(xiàn)問題，則不能加工。對(duì)食品凍干機(jī)的日常維護(hù)或保養(yǎng)要格外重視，一旦出現(xiàn)故障，就要迅速排除，保證生產(chǎn)的正常進(jìn)行。為保證正常運(yùn)行及空氣質(zhì)量，一定要在保養(yǎng)時(shí)注意很多問題。
    在制冷循環(huán)中，必須預(yù)防水分與污染物（油污、鐵屑、銅屑）的進(jìn)入，水分來源途徑就是新添加的制冷劑和潤(rùn)滑油所含微量水份，或在檢修系統(tǒng)時(shí)，因空氣進(jìn)入而帶來水分。
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